̽»¨¾«Ñ¡

David Plaza

David Plaza

Biträdande Lektor
E-postadress: david.plaza@ki.se
µþ±ð²õö°ì²õ²¹»å°ù±ð²õ²õ: B2:03, Karolinska Universitetssjukhuset Solna, 17176 Stockholm
Postadress: K2 Medicin, Solna, K2 Infekt Färnert A, 171 77 Stockholm
Del av:

Om mig

  • *Fundacion Instituto de Inmunologia de Colombia. Bogota, Colombia. Department of Molecular Biology. Postdoctoral fellow. 

    *Harvard University. Cambridge, Massachusetts, USA. Postdoctoral fellow. Department of Molecular and Cellular Biology.

    *ETH Zurich. Zurich, Switzerland. *PhD in Microbiology and Immunology. Institute of Microbiology. Group Prof. Dr. Markus Aebi and Prof. Dr. Markus 
    °­Ã¼²Ô³ú±ô±ð°ù
    *Uppsala University. Uppsala, Sweden.* MSc in Biology (Immunology and Infection Biology). Faculty of Science and Technology. Group Prof. Dr. Sandra
    Kleinau
    *Universidad Nacional de Colombia.* *Bogotá, Colombia.* BSc in Biology. Department of Biology. Faculty of Science. Group Prof. Dr. Lucy Gabriela
    Delgado

Forskningsbeskrivning

  • Malaria orsakar en halv miljon dödsfall varje Ã¥r och ett fullt skyddande vaccin behövs akut. Plasmodium falciparum använder antigenisk variabilitet som en flyktstrategi frÃ¥n värdens immunrespons; dessutom driver strukturell variation och den utbredda förekomsten av insättningar och deletioner en stor del av den genetiska mÃ¥ngfalden hos parasiten. Därför kräver utformningen av ett vaccin mot malaria som överskrider stammar en noggrann urval av antigen som tar hänsyn till den sekvensmÃ¥ngfald som observeras i proteiner pÃ¥ en populationsnivÃ¥. Trots nyligen framsteg inom höggenomströmmande sekvensering är det antigena repertoaret av P. falciparum till stor del okänt. Trots detta har flera proteiner frÃ¥n parasiten utvecklats till subenhetbaserade vacciner medan bara nÃ¥gra fÃ¥ har tagit hänsyn till den polymorfa naturen hos parasitens antigen. I mitt projekt försöker jag överbrygga klyftan som finns mellan den molekylära epidemiologin och den genetiska mÃ¥ngfalden hos polymorfa antigen som visat sig vara viktiga i utvecklingen av naturligt förvärvad immunitet mot P. falciparum, och utformningen av en vaccinformulering som är kapabel att framkalla skydd som överskrider stammar mot mänsklig malaria.

    Dessutom använder jag AI-modelleringsverktyg (t.ex. Alphafold2) för att identifiera epitoper på parasitproteiner som kan riktas av neutraliserande antikroppar, samt mänskliga allelvarianter som är involverade i naturlig resistens mot malaria.

Undervisning

  • Sedan 2019 har jag koordinerat den största uppgiften för kursen "Molekylärmedicin - Kardiometaboliska och Infektionssjukdomar" som är en del av grundprogrammet i Biomedicin. Jag är ocksÃ¥ föreläsare för doktorandkursen "Grundläggande Immunologi" som tillhör programmet i Allergi, Immunologi och Inflammation pÃ¥ MedS där jag hÃ¥ller föreläsningen "Immunsvaret pÃ¥ Protozoa Infektioner". Sist men inte minst har jag varit huvudorganisatören och en av föreläsarna för den tvååriga doktorandkursen "Klinisk och Molekylär Parasitologi och Mykologi" (5234, 1, 5 högskolepoäng) som erbjuds av MTC Ã¥r 2021 och 2023.

Artiklar

  • Journal article: TRENDS IN PARASITOLOGY. 2024;40(11):956-958
    Zerebinski J; Plaza DF
  • Article: CELL REPORTS: METHODS. 2023;3(9):100574
    Plaza DF; Zerebinski J; Broumou I; Lautenbach MJ; Ngasala B; Sundling C; Farnert A
  • Article: GLYCOBIOLOGY. 2022;32(7):600-615
    Bleuler-Martinez S; Varrot A; Olieric V; Schubert M; Vogt E; Fetz C; Wohlschlager T; Plaza DF; Waelti M; Duport Y; Capitani G; Aebi M; Kuenzler M
  • Article: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. 2022;23(9):4916
    Renko M; Zupan T; Plaza DF; Schmieder SS; Perisic Nanut M; Kos J; Turk D; Kuenzler M; Sabotic J
  • Article: CELL REPORTS. 2022;39(3):110709
    Lautenbach MJ; Yman V; Silva CS; Kadri N; Broumou I; Chan S; Angenendt S; Sonden K; Plaza DF; Farnert A; Sundling C
  • Article: METHODS IN MOLECULAR BIOLOGY. 2022;2470:51-68
    Broumou I; Plaza DF; Färnert A
  • Article: JOURNAL OF PROTEOMICS. 2021;231:104002
    Molina-Franky J; Fernando Plaza D; Merali C; Merali S; Barrero C; Arevalo-Pinzon G; Elkin Patarroyo M; Alfonso Patarroyo M
  • Article: CELLULAR IMMUNOLOGY. 2020;347:103999
    Plaza DF; Gomez MF; Patarroyo MA
  • Article: MEDICINE. 2019;98(11):e14879
    Solano-Varela DM; Barrios-Vidales EM; Plaza DF; Riveros WM; Guzman J; Chica CE; Patarroyo MA
  • Article: APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY. 2018;84(23):e02051-e02018
    Tayyrov A; Schmieder SS; Bleuler-Martinez S; Plaza DF; Kuenzler M
  • Article: FUNGAL GENETICS AND BIOLOGY. 2017;102:49-62
    Stockli M; Lin C-W; Sieber R; Plaza DF; Ohm RA; Kunzler M
  • Article: G3-GENES GENOMES GENETICS. 2015;6(1):87-98
    Plaza DF; Schmieder SS; Lipzen A; Lindquist E; Kuenzler M
  • Article: BMC GENOMICS. 2014;15(1):492
    Plaza DF; Lin C-W; Sebastiaan N; Van der Velden J; Aebi M; Kuenzler M
  • Article: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. 2012;287(34):28276-28290
    Yan S; Bleuler-Martinez S; Plaza DF; Kuenzler M; Aebi M; Joachim A; Razzazi-Fazeli E; Jantsch V; Geyer R; Wilson IBH; Paschinger K
  • Journal article: BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY. 2011;65(8):569-577
    Delgado G; Sanchez Y; Plaza D; Marino A; Granados D
  • Journal article: TOXICOLOGY LETTERS. 2010;196:s247
    Delgado G; Sánchez Y; Plaza D; Mariñol A; Granadosl D
  • Article: BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY. 2009;63(6):436-441
    Salguero E; Plaza D; Marino A; Moreno C; Delgado G
  • Article: VACCINE. 2008;26(34):4387-4395
    Patarroyo MA; Curtidor H; Plaza DF; Ocampo M; Reyes C; Saboya O; Barrera G; Patarroyo ME
  • Article: BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS. 2008;372(4):935-940
    Patarroyo MA; Plaza DF; Ocampo M; Curtidor H; Forero M; Rodriguez LE; Patarroyo ME
  • Article: PROTEIN SCIENCE. 2008;17(2):342-351
    Chapeton-Montes JA; Plaza DF; Curtidor H; Forero M; Vanegas M; Patarroyo ME; Patarroyo MA
  • Visa fler

Alla övriga publikationer

  • Preprint: BIORXIV. 2021
    Lautenbach MJ; Yman V; Kadri N; Plaza DF; Angenendt S; Sondén K; Färnert A; Sundling C

Forskningsbidrag

  • Identification of neutralizing epitopes and host-tropism residues in malaria vaccine candidates using AI-supported prediction of protein-protein interaction interfaces with Alphafold2
    TORE NILSONS STIFTELSE FÖR MEDICINSK FORSKNING
  • Harnessing the power of deep learning and plasma biobanking for malaria vaccine development
    Stiftelsen Clas Groschinskys Minnesfond
  • Development of a multiplex antigen profiling platform for large malaria cohorts using circular consensus sequencing of long amplicons
    ̽»¨¾«Ñ¡s Forskningsstiftelser

Nyheter från KI

Kalenderhändelser från KI